Разница может заключаться в компоновке, прозрачность очень дорога в вычислениях, а выполнение многих перекрывающихся вещей может быстро затормозить.
Возможно, вам лучше перейти на OpenGL (или библиотеку, подобную Cocos2D), если вы делаете сложную спрайтовую анимацию. Вы можете использовать OpenGL, смешанный с обычными представлениями ...