Если можете, попробуйте перезапустить IIS и посмотреть, поможет ли это.
Я сталкивался с этим пару раз, часто, когда в IIS размещается несколько сайтов. Я не знаю, если это обработчики или фильтры, которые в конечном итоге заглохнут и начнут действовать странно, и я, честно говоря, не удосужился устранить их дальше, чем перезапуск IIS или, в худшем случае, сервера.