В вашем конкретном случае вы можете просто использовать точку с запятой в конце, чтобы запустить его, т.е.
!(python --version; \
which python; \
pip --version; \
conda --version; \
which conda) >> config-environment.txt
В общем случае вы можете использовать команду %%bash
cell magic для запуска ячейки в bash, т.е.
%% bash script magic
Запустить ячейки с bash в подпроцессе.
%%bash
(python --version
which python
pip --version
conda --version
which conda) >> config-environment.txt
Вы также можете взглянуть на subprocess
модуль python.