Первое предупреждение относится к FxCop и, вероятно, означает, что FxCop не установлен на вашем компьютере сборки. Это не повлияет на анализ Рослина.
Второе предупреждение актуально. Аналитические отчеты Roslyn записываются в виде файлов JSON. Тем не менее, v1 Roslyn в некоторых случаях выдает недействительный json. Сканер проверяет, является ли файл допустимым json, и если нет, пытается его исправить.
Это предупреждение говорит о том, что анализ выполняется, но выдает неверный файл, который сканер не может исправить. Убедитесь, что созданный отчет JSON является действительным JSON. MSBuild 15 имеет более новую версию Roslyn, в которой нет этой проблемы.
[Обновление] MSBuild 15 устанавливается с инструментами сборки для Visual Studio 2017, доступно здесь