GraphQL - это формат запросов любого типа данных, но реляционные базы данных - это то место, где живет большая часть данных в мире, поэтому существует программное обеспечение, такое как Apollo Server, которое осуществляет чтение и запись в базы данных, и, естественно, они будут использовать SQL, поскольку это как они работают.