Код, поставляемый с BSDS500, написан для MATLAB в Linux или MacOS (это POSIX-совместимые системы, на которых работает MATLAB).
Если вы работаете в Windows, вы можете попробовать использовать Cygwin для создания этих двоичных файлов. Cygwin добавляет слой POSIX в Windows. Сам по себе MinGW этого не делает, он предоставляет только инструменты GNU для Windows. Файл sys/times.h
определен в стандарте POSIX.
Но, IMO, вам лучше перейти на Linux. Не только для BSDS500, но и для всего остального тоже ...:)