Ошибка в rowSums (Qf): «x» должен быть массивом как минимум двух измерений (msm :: msm2surv)

Question

Я использую функцию msm2surv в пакете msm и пытаюсь преобразовать продольные данные в формат пакета flexsurve. Ниже приведен мой пример под названием tmp.

tmp <- structure(list(id = c(89, 90, 90, 91, 91, 91, 92, 92, 93, 93, 
94, 94, 94, 95, 95, 96), days = c(9157, 0, 9156, 0, 8394, 9156, 
0, 9156, 0, 8079, 0, 8933, 9003, 0, 8430, 0), event = c(1, 1, 
1, 1, 2, 2, 1, 1, 1, 5, 1, 3, 6, 1, 4, 1)), row.names = c(NA, 
-16L), class = c("grouped_df", "tbl_df", "tbl", "data.frame"), vars = "id", drop = TRUE, indices = list(
    0L, 1:2, 3:5, 6:7, 8:9, 10:12, 13:14, 15L), group_sizes = c(1L, 
2L, 3L, 2L, 2L, 3L, 2L, 1L), biggest_group_size = 3L, labels = structure(list(
    id = c(89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96)), row.names = c(NA, 
-8L), class = "data.frame", vars = "id", drop = TRUE, .Names = "id"), .Names = c("id", 
"days", "event"))

рабочие коды:

library(msm)
Q <- matrix(c( 
  0,1,1,1,1,0, 
  0,0,1,1,1,1, 
  0,0,0,1,1,1, 
  0,0,0,0,1,1, 
  0,0,0,0,0,0, 
  0,0,0,0,0,0
), nrow=6, ncol=6, 
byrow=TRUE, 
dimnames=list(from=1:6,to=1:6)) 

dat <- msm2Surv(data=tmp, subject="id", time="days", state="event", Q=Q)

Это дает мне ошибку: Ошибка в rowSums (Qf): 'x' должен быть массивом по крайней мере двух измерений.

Я проверил размерность кадра данных, для меня это нормально. Но ошибка есть. Все знают, как решить проблему / ошибку?

Большое спасибо!

Answer 1

Мы можем преобразовать tbl_df в data.frame, и оно должно работать

out <- msm2Surv(data=as.data.frame(tmp), subject="id",
               time="days", state="event", Q=Q)
dim(out)
#[1] 31  8

Набор данных "tmp" является сгруппированным tbl_df и имеет много атрибутов. Преобразовав в data.frame, мы удалим эти атрибуты.