У вас есть правило только для порта 80, который является обычным http: // protocol
Я не вижу правила для порта 443: https
вам нужно добавить следующее
<VirtualHost *:443>
ServerName support.nile.sd
DocumentRoot /var/www/site
SSLEngine on
SSLCertificateFile /path/to/www_yoursite_com.crt
SSLCertificateKeyFile /path/to/www_yoursite_com.key
SSLCertificateChainFile /path/to/DigiCertCA.crt
Redirect permanent / https://support.nile.sd/otrs/customer.pl
</VirtualHost>