Важным является отступ в параметрах YAML. В настоящее время у вас есть bibliography
в разделе output
, но его следует поместить в YAML верхнего уровня.
title: "Title"
author: "Author"
output:
pdf_document:
keep_tex: true
bibliography: bib.bib
Редактировать : Убедитесь, что вы полностью переместили библиографию из параметров pdf_document
, как указано ниже:
author: "Author"
output:
pdf_document:
keep_tex: true
fig_caption: yes
number_sections: yes
bibliography: bib.bib
---