Я только что попробовал и проверил это. Тарификация рассчитывается на основе общего количества проверок телефона пользователями. Так что в вашем случае, если все 1000 пользователей выйдут из системы, а затем снова войдут в систему и повторите это более 5 раз, вы использовали бы 5000 проверок из вашего месячного лимита проверки.
Количество отправленных SMS с подтверждением, однако, не имеет значения и не учитывается при ежемесячном использовании подтверждения.
Надеюсь, это поможет:)