Я запускаю JVM с опцией
-agentpath:/home/adeptius/.jprofiler10/agent/10204_10.1.2/jprofiler10/bin/linux-x64/libjprofilerti.so=port=7001,nowait
Он работает и графический интерфейс от Windows успешно подключен.
Но если мой компьютер перейдет в режим гибернации или произойдет временное отключение - jProfiler не сможет подключиться второй раз (GUI бесконечно пытается подключиться). В журнале удаленного компьютера:
JProfiler> Reconnection.
JProfiler> Using sampling (5 ms)
JProfiler> Time measurement: elapsed time
JProfiler> CPU profiling enabled
Есть только один способ заставить jProfiler работать снова - перезапустить webApp.
upd: Если подключить и отключить правильно (из кнопки выхода в GUI) - все ок.