Я думаю, вы можете попробовать с awk
awk -v OFS="\t" '$1=$1' file1
или САС, если вы предпочитаете
sed 's/[:blank:]+/,/g' thefile.txt > the_modified_copy.txt
или даже tr
tr -s '\t' < thefile.txt | tr '\t' ' ' > the_modified_copy.txt
или упрощенный вариант решения tr, предложенного Сэмом Бисби
tr ' ' \\t < someFile > someFile