Это известная ошибка, введенная Xcode 10, которая исправлена в CocoaPods 1.6.0. Прямо сейчас (январь 2019 г.) он находится в бета-версии, поэтому вы можете установить его с
sudo gem install cocoapods --pre
Альтернативное решение для CocoaPods 1.5.3 можно найти здесь .