Я думаю, вполне очевидно, что создание одной организации на пользователя, когда у вас миллионы пользователей, не очень хорошая идея. В Hyperledger у организации были бы собственные коллеги, и это не то, что имеет смысл на уровне пользователя. В дополнение к этому, управление практически неограниченной сетью с неограниченным количеством оргов и каналов просто не практично даже с точки зрения обслуживания, не говоря уже о точке сборки.
Я предлагаю вам изучить другие способы обеспечения безопасности пользовательских данных. Одним из способов было бы зашифровать его, хэшировать, что бы ни имело смысл для вашего собственного сценария, и только потом сохранять его в бухгалтерской книге. Но тогда пользователи все равно будут частью одной или нескольких организаций, где общее количество организаций является чем-то управляемым.
Из того, что вы сказали до сих пор, я не уверен, что Hyperledger - это путь для вас. Возможно, ваша собственная сеть Ethereum будет работать для этого лучше, поскольку у вас есть учетные записи на уровне пользователя. Если вам не нужно решение блокчейна, вы можете захотеть придерживаться стандартного способа создания чего-то подобного.