Для этого достаточно установить на компьютер платформу .NET. Если установлена правильная среда, это не будет проблемой - просто запустите исполняемый файл.
Для таких инструментов, как NGEN, требуется установка фреймворка.
Однако есть некоторые коммерческие инструменты, такие как PostBuild , которые пройдут и скомпилируют все необходимые зависимости в собственный код. Теоретически, это обеспечит необходимое поведение.