Это довольно утомительно, но вам, возможно, придется сделать что-то вроде этого:
=SUM(IFERROR(AVERAGEIFS(A1:A2,A1:A2,">"&0),0),IFERROR(AVERAGEIFS(B1:B2,B1:B2,">"&0),0),IFERROR(AVERAGEIFS(C1:C2,C1:C2,">"&0),0))
/SUM(--ISNUMBER(AVERAGEIFS(A1:A2,A1:A2,">"&0)),--ISNUMBER(AVERAGEIFS(B1:B2,B1:B2,">"&0)),--ISNUMBER(AVERAGEIFS(C1:C2,C1:C2,">"&0)))
EDIT
=SUM(IFERROR(AVERAGEIFS(A1:A2,A1:A2,">"&0),0),IFERROR(AVERAGEIFS(B1:B2,B1:B2,">"&0),0),IFERROR(AVERAGEIFS(C1:C2,C1:C2,">"&0),0))
/COUNT(AVERAGEIFS(A1:A2,A1:A2,">"&0),AVERAGEIFS(B1:B2,B1:B2,">"&0),AVERAGEIFS(C1:C2,C1:C2,">"&0))
немного короче - Счет игнорирует любые # DIV / 0!