Кажется, что ширина этой линии составляет 1 пиксель.
В этом случае вы можете избавиться от линии с горизонтальным медианным фильтром размера 3 (применительно к узкому столбцу)
Редактировать
С реальной картинкой мы видим горизонтальные дефектные ряды.
Сначала вы можете определить их Y-положение, используя фильтры для выявления краев, такие как Sobel.
Затем примените медианный фильтр с преимущественно вертикальной апертурой только к плохим областям (или к какой-то интерполяции, как заметил @SilverMonkey в комментариях).
Пример быстрой обработки OpenCV с CV_MEDIAN filter size 11 x 3
, примененной дважды с двумя ROI (областью интересов) вблизи y = 110 и y = 205. Обратите внимание на хорошую компенсацию второго дефекта, но первый требует больше работы. Особенности сохранились.