Самым простым является удаление файла перед записью в него через i.e. Files.deleteIfExists () Функция Добавьте следующую строку в ваш скрипт, который удалит файл, если он уже существует:
java.nio.file.Files.deleteIfExists(file.toPath())
Полный код на всякий случай:
def file = new File(path + 'fileName.csv');
java.nio.file.Files.deleteIfExists(new File().toPath())
List.unique().each { element ->
file << element << newLine
}
См. Шпаргалку шаблонов Groovy для JMeter для получения дополнительных подсказок