Вы были на правильном пути, вы только что сделали небольшую ошибку, вам нужно поставить checked
или checked="checked"
вместо checked=true
<td>
<?php if($status == "1"){ ?>
<input type="checkbox" name="status" value="Yes" checked >
</td>
<td>
<?php } if ($status == "0") { ?>
<input type="checkbox" name="status" value="No" >
</td>
<?php } ?>
Вы могли бы сделать его более читабельным, написав это так
<td>
<input type="checkbox" name="status" value="Yes" <?= $status ? 'checked' : '' ?> >
</td>
<td>
<input type="checkbox" name="status" value="No" <?= !$status ? 'checked' : '' ?> >
</td>