$("#item").removeClass();
Вызов removeClass
без параметров удалит все классы элемента.
Вы также можете использовать (но не обязательно рекомендуется, правильный способ, описанный выше):
$("#item").removeAttr('class');
$("#item").attr('class', '');
$('#item')[0].className = '';
Если у вас не было jQuery, то это был бы ваш единственный вариант:
document.getElementById('item').className = '';