В общем случае безопасность по неизвестности не работает. Если вы полагаетесь на тот факт, что кто-то чего-то не знает, это означает, что вы уязвимы для определенных атак, поскольку вы слепите себя к ним.
Следовательно, идти по этому пути опасно. Выберите успешную CMS и сразу же установите все доступные исправления безопасности. Используя известную CMS, вы быстро получаете исправления безопасности. Ваш самый большой враг - время; Злоумышленники могут найти тысячи уязвимых сайтов с помощью Google и атаковать их одновременно с помощью бот-сетей. Это полностью автоматизированный процесс сегодня. Попытка скрыть, какое программное обеспечение вы используете, не остановит ботов от взлома вашего сайта, поскольку они не проверяют, какую уязвимость они могут ожидать; они просто пробуют топ-10 самых успешных на данный момент эксплойтов.
[EDIT] Бот-сети с 10'000 ботами сегодня не редкость. Пока установка исправлений безопасности очень трудна, люди не будут защищать свои компьютеры, а это значит, что у злоумышленников будет много ресурсов для атаки. Кроме того, есть сайты, которые продают эксплойты в виде готовых к использованию плагинов для ботов (или ботов, или арендуют целые бот-сети).
Так что, пока уязвимость сохраняется, маскировка вашего сайта не поможет.