Avro: ClassCastException при сериализации / десериализации файла, содержащего значение Enum - PullRequest
Новая
       10

Avro: ClassCastException при сериализации / десериализации файла, содержащего значение Enum

0 голосов
/ 07 сентября 2018

Я получаю следующую ошибку при попытке десериализации ранее сериализованного файла: 

Exception in thread "main" java.lang.ClassCastException: 
com.ssgg.bioinfo.effect.Sample$Zygosity cannot be cast to 
com.ssgg.bioinfo.effect.Sample$.Zygosity
at com.ssgg.ZygosityTest.deserializeZygosityToAvroStructure(ZygosityTest.java:45)
at com.ssgg.ZygosityTest.main(ZygosityTest.java:30)

Чтобы воспроизвести ошибку, основной класс выглядит следующим образом: 

public class ZygosityTest {

public static void main(String[] args) throws JsonParseException, JsonMappingException, IOException {

    String filepath = "/home/XXXX/zygosity.avro";

    /* Populate Zygosity*/
    com.ssgg.bioinfo.effect.Sample$.Zygosity zygosity = com.ssgg.bioinfo.effect.Sample$.Zygosity.HET;

    /* Create file serialized */
    createZygositySerialized(zygosity, filepath);

    /* Deserializae file */
    com.ssgg.bioinfo.effect.Sample$.Zygosity avroZygosityOutput = deserializeZygosityToAvroStructure(filepath);

}

private static com.ssgg.bioinfo.effect.Sample$.Zygosity deserializeZygosityToAvroStructure(String filepath)
        throws IOException {
    com.ssgg.bioinfo.effect.Sample$.Zygosity zygosity = null;

    File myFile = new File(filepath);
    DatumReader<com.ssgg.bioinfo.effect.Sample$.Zygosity> reader = new SpecificDatumReader<com.ssgg.bioinfo.effect.Sample$.Zygosity>(
            com.ssgg.bioinfo.effect.Sample$.Zygosity.class);
    DataFileReader<com.ssgg.bioinfo.effect.Sample$.Zygosity> dataFileReader = new DataFileReader<com.ssgg.bioinfo.effect.Sample$.Zygosity>(
            myFile, reader);

    while (dataFileReader.hasNext()) {
        zygosity = dataFileReader.next(zygosity);
    }

    dataFileReader.close();
    return zygosity;
}

private static void createZygositySerialized(com.ssgg.bioinfo.effect.Sample$.Zygosity zygosity, String filepath)
        throws IOException {
    DatumWriter<com.ssgg.bioinfo.effect.Sample$.Zygosity> datumWriter = new SpecificDatumWriter<com.ssgg.bioinfo.effect.Sample$.Zygosity>(
            com.ssgg.bioinfo.effect.Sample$.Zygosity.class);
    DataFileWriter<com.ssgg.bioinfo.effect.Sample$.Zygosity> fileWriter = new DataFileWriter<com.ssgg.bioinfo.effect.Sample$.Zygosity>(
            datumWriter);

    Schema schema = com.ssgg.bioinfo.effect.Sample$.Zygosity.getClassSchema();

    fileWriter.create(schema, new File(filepath));
    fileWriter.append(zygosity);
    fileWriter.close();
}

}

Сгенерированное авро перечисление для Zygosity выглядит следующим образом: 

/**
* Autogenerated by Avro
*
* DO NOT EDIT DIRECTLY
*/
package com.ssgg.bioinfo.effect.Sample$;
@SuppressWarnings("all")
@org.apache.avro.specific.AvroGenerated
public enum Zygosity {
  HOM_REF, HET, HOM_VAR, HEMI, UNK  ;
  public static final org.apache.avro.Schema SCHEMA$ = new     org.apache.avro.Schema.Parser().parse("{\"type\":\"enum\",\"name\":\"Zygosity\",\"namespace\":\"com.ssgg.bioinfo.effect.Sample$\",\"symbols\":[\"HOM_REF\",\"HET\",\"HOM_VAR\",\"HEMI\",\"UNK\"]}");
  public static org.apache.avro.Schema getClassSchema() { return SCHEMA$; }

}

Я новичок в Avro, может кто-нибудь попросит помочь мне найтиэта проблема?В моем проекте я пытаюсь сериализовать и десериализовать большую структуру, но у меня есть проблемы с перечислениями, поэтому я выделил небольшую проблему здесь.Если вам нужна дополнительная информация, я могу опубликовать ее.Спасибо.

1 Ответ

0 голосов
/ 11 сентября 2018

Я считаю, что главная проблема здесь заключается в том, что $ имеет особое значение в классах Java, и менее важно то, что имена пакетов обычно в нижнем регистре.

Итак, вы должны хотя бы отредактировать пространства имен, чтобы удалить $

...