Граничные условия Дирихле связаны с узловыми степенями свободы; Граничные условия Неймана описывают потоки / тяги на гранях элементов.
Граничные условия Дирихле будут указаны в узлах. Идентификаторы узлов здесь уместны.
Граничные условия Неймана указаны на гранях элементов.
Они разделены по определению и необходимости. Я не уверен насчет инструмента генерации Tetgen, но думаю, что нумерация узлов и элементов не должна зависеть от ваших граничных условий.