Столкнувшись с той же проблемой.
com.google.appengine.api.search.SearchException: ошибка при создании заглушки для приложения h ~ xxxx
на com.google.appengine.api.search.IndexImpl $ 4.convertException (IndexImpl.java:352)
на com.google.appengine.api.utils.FutureWrapper.get (FutureWrapper.java:109)
на com.google.appengine.api.search.FutureHelper.getInternal (FutureHelper.java:74)
на com.google.appengine.api.search.FutureHelper.quietGet (FutureHelper.java:33)
на com.google.appengine.api.search.IndexImpl.search (IndexImpl.java:502)
На данный момент понятия не имею.
Обновление (24 января 2019 г.)
Не получено этой проблемы с 22 января 2019 года. На основании последнего обновления от группы поддержки Google команда инженеров Google обнаружила эту ошибку, и ей удалось ее устранить.