Для моей настройки TeamCity у меня есть глобальная переменная для моих исключений SonarQube. Я могу изменить все исключения или переопределить для конкретных проектов. Если вы хотите установить это программно, вы можете использовать TeamCity API для обновления аналогичной переменной на уровне проекта или на глобальном уровне.
Если вам нужна отправная точка, у меня есть скрипт, который обновляет номера сборки, которыми я могу поделиться.