Установка размера с помощью NetworkX будет просто игнорироваться Gephi. Итак, лучший способ добиться этого, который я нашел, - это установить размер каждого узла, используя атрибут в атрибуте 'viz'
.
Например, чтобы сделать размер всех узлов 200
:
for node in G.nodes():
G.node[node]['viz'] = {'size': 200}