Вы можете установить время ожидания скрипта в настройках публикации инструментов Flash Authoring (CTRL + SHIFT + F12), это последний параметр на вкладке Flash. Если вы используете mxmlc для компиляции, проверьте параметр -default-script-limit .
Однако лучше разделить ваши расчеты на несколько кадров, пользователи, скорее всего, подумают, что ваше приложение зависло, если оно не отвечает в течение нескольких секунд.