Вы можете сделать так, чтобы GreaseMonkey добавил свою собственную ссылку на javascript, но проблема, вероятно, заключается в том, что ваш код jQuery уже запустится до загрузки jQuery. Можно ли вызвать код jQuery после того, как ваш скрипт GreaseMonkey снова загрузит jQuery? Похоже, вам нужно было бы перезапустить выполнение кода jQuery на странице, чтобы получить желаемые результаты.