Реестр Lua - это просто обычная таблица Lua. Там просто нет ссылки на него из глобального контекста.
Вы можете, например, используйте функцию debug.getregistry(), чтобы получить ее.
Но будь уверен, что знаешь, что делаешь.
И, конечно, не все библиотеки хранят свои данные в реестре. Некоторые из них используют, например, upvalues или uservalues для хранения некоторой внутренней структуры. Также любая библиотека может изменить свои внутренние компоненты в любое время. И большинство из них, я думаю, не ожидали, что их данные будут изменены снаружи.