Я пытаюсь скомпилировать эту библиотеку C ++ / Python https://bitbucket.org/fluiddyn/fluidfft
Если установлен mpi4py, он работает хорошо.
Если mpi4py не установлен, код, который не использует MPI, не может быть скомпилирован.
Ошибка возникает во время компиляции файла Cython. Ошибка длинная и начинается с:
In file included from /usr/include/c++/6/bits/ios_base.h:46:0,
from /usr/include/c++/6/ios:42,
from /usr/include/c++/6/ostream:38,
from /usr/include/c++/6/iostream:39,
from src_cpp/base/base_fft.h:10,
from fluidfft/fft2d/fft2d_with_fftw1d.cpp:543:
/usr/include/c++/6/system_error:143:31: error: ‘error_category’ does not name a type
error_code(int __v, const error_category& __cat) noexcept
^~~~~~~~~~~~~~
/usr/include/c++/6/system_error:152:27: error: ‘error_category’ does not name a type
assign(int __v, const error_category& __cat) noexcept
^~~~~~~~~~~~~~
/usr/include/c++/6/system_error:172:11: error: ‘error_category’ does not name a type
const error_category&
^~~~~~~~~~~~~~
/usr/include/c++/6/system_error:191:11: error: ‘error_category’ does not name a type
const error_category* _M_cat;
[...]
Я думаю, это может быть проблема C ++ 11 (http://en.cppreference.com/w/cpp/error/error_category), но я не понимаю, как решить эту проблему.
Команда компиляции:
g++ -pthread -fwrapv -O3 -Wall -Wno-unused-result -Wsign-compare -Wno-unused-result -Wsign-compare -fwrapv -O3 -Wall -fPIC -I/home/users/me/opt/miniconda3/include/python3.6m -I/home/users/me/opt/miniconda3/include -Isrc_cy -Ifluidfft/fft2d -Ifluidfft/fft3d -Isrc_cpp/base -Isrc_cpp/3d -Isrc_cpp/2d -Iinclude -I/home/users/me/opt/miniconda3/lib/python3.6/site-packages/numpy/core/include -c fluidfft/fft2d/fft2d_with_fftw1d.cpp -o build/temp.linux-x86_64-3.6/fluidfft/fft2d/fft2d_with_fftw1d.o
Редактировать минимальный, полный и проверяемый пример
Благодаря Ашвину Вишну (см. https://bitbucket.org/fluiddyn/fluidfft/issues/7/fluidfft-installation-fails-without-mpi4py), Я могу опубликовать минимальный пример
/* test.cpp */
#include <Python.h>
#include <string.h>
#include <stdio.h>
#include <cpu.h>
#include <sys/time.h>
#include <complex>
#include <iostream>
int main() {
std::cout<<"Hello world";
return 0;
}
скомпилировано из каталога liquidfft следующим образом:
g++ $(python-config --include) -Iinclude/ test.cpp
Если мы закомментируем cpu.h include, ошибок не будет.
Файл cpu.h был взят из кода pyfftw: https://github.com/pyFFTW/pyFFTW/blob/master/include/cpu.h