Как изменить размеры оси в pca2d?

Question

Я использую пакет pca3d для построения основных компонентов 1-5 данных экспрессии генов. Мне было трудно стандартизировать трехмерный график, поэтому вместо этого я нарисовал ПК1 против ПК2, ПК2 против ПК3 и т. Д. Мой код для этого ниже

par(mfrow = c(2,2))
for(n in 1:4){

  pca2d(pcaSix$x[,n:(n+1)], # Mclust Grouping - module Genes
        title = "Six Genes From Abel, et al. 2011",
        shape = 16,
        group = clustersMod1six,
        radius = 1,
        legend = NULL,
        show.centroids = FALSE,
        show.ellipses = TRUE,
        col = ClusterColorsSix,
        axe.titles = c(paste("PCA",
                             n,
                             sep = ""),
                       paste("PCA",
                             n+1,
                             sep = "")
                       ),
        xlim = c(-1,1),
        ylim = c(-1,1)
        ) 

}

Проблема, с которой я столкнулся, заключается в том, что аргументы xlim и ylim не влияют на сюжет. Я обнаружил в этом посте , в котором предлагалось использовать аргумент asp , но установка asp не позволила мне изменить оси.

Кто-нибудь знает, как я мог заставить pca2d изменить пределы осей?

Answer 1

Без изменения функции невозможно управлять осями. См строка 32 :

plot(NULL, type= "n", 
  xlim= prange$x,
  ylim= prange$y,
  xlab= xlab,
  ylab= ylab,
  bty= "none"
  )