Я нашел решение.Вы можете добавить экземпляр класса java в javascript, используя:
Object wrappedTest = Context.javaToJS(test, scope);
ScriptableObject.putProperty(scope, "test", wrappedTest); //Where text here is name of the variable
Чем вы можете использовать методы этого класса внутри javascript, даже если вы используете контекст init, используя initSafeStandardObjects
Object result = cx.evaluateString(scope, "test.sampleMethod()", "<cmd>",1, null);
System.out.println(cx.toString(result));