В одну сторону с помощью Perl
$ perl -e ' BEGIN { @a=map{chomp;$_} qx(cat fileA); @b=map{chomp;$_} qx(cat fileB); printf("%s %s\n",$a[$_],$b[$_]) for (0..$#a) } '
1 1
2 2
3 3
$
Обычно это делается с помощью команды вставки
$ paste -d" " fileA fileB
1 1
2 2
3 3
$
Ваши входные данные
$ cat fileA
1
2
3
$ cat fileB
1
2
3
$
Команда вставки просто объединяет файлы по вертикалииспользуя разделитель вкладок по умолчанию.Вы можете переопределить разделитель, используя опцию -d