Проект Qyoto , кажется, подходит, и он все еще активен. У меня нет опыта с этим, хотя.
Обратите внимание, что если приложение простое (т.е. не использует сторонние компоненты и не использует "хаки" для изменения поведения), вы также можете попробовать простое приложение WinForms, которое должно нормально работать на Mono. И, ну, если вам на самом деле не нужен графический интерфейс, вам ничего не нужно, кроме Mono. Кстати, сам проект Mono предпочитает Gtk #, а не Qt.