Довольно плохо знаком с Python и получаю ошибку: объект 'module' не может быть вызван.
По сути, у меня есть модель с некоторыми реакциями, я использую цикл for, который изменяет некоторые значения выбранных реакций, а затемЯ хочу построить график выхода модели в зависимости от изменения параметра.Возможно, мой код даст более краткий ответ, поэтому вот он:
import cobra
import os
from os.path import join
import matplotlib.pyplot as plt
data_dir = '/Users/stephenchapman/Documents/research/FBA_algae_digesate/COBRApy/iCZ843/iCZ843_models'
model = cobra.io.read_sbml_model(join(data_dir, "iCZ843_mixo.xml"))
NH4_exchange = []
fluxes = []
for i in range(0,100,10):
model.reactions[15].lower_bound = -i
model.reactions[15].upper_bound = -i
solution = model_mixo.optimize()
solution.f
fluxes.append(solution.f)
NH4_exchange.append(model.reactions[15].lower_bound)
plt('fluxes','NH4_exchange')
plt.show()
Может кто-нибудь помочь мне с этим?
Приветствия
S.