как сделать водяные знаки и конвертировать видео в формат flv с помощью ffmpeg?
Вот четвертый результат поиска по «водяному знаку ffmpeg»: Добавление водяного знака к видео с помощью ffmpeg .
ffmpeg -sameq -i video1.mp4 -vhook '/usr/lib64/vhook/watermark.so' \ -f img.jpg video2.mp4
Вот четвертый хит поиска ffmpeg convert flv: Преобразование в FLV (флэш-видео) с помощью ffmpeg (редактировать: похоже, что Konamiman победил меня).
ffmpeg -i someVideo.avi -f flv -b 200000 someVideo.flv
Для преобразования в flv см. Здесь: http://parallaxed.net/article/convert-to-flv-flash-video-with-ffmpeg
А для водяных знаков см., Например, здесь: http://linux.goeszen.com/watermark-video-with-ffmpeg.html