Полагаю, вы могли бы использовать массив в качестве имени, чтобы упростить его, и попробовать что-то вроде этого.
Form::checkbox('schemeIDS[]', $subsc->Scheme->Scheme_id, true);
// Parameters checkbox: name, value, checked
В функции контроллера используйте
$schemeIDS = $request->get('schemeIDS'); // get all the checked values as array
foreach($schemeIDS as $schemeID)
{
// insert into the database
}