Архивирование таблиц не повлияет на Аврору. Неиспользованные страницы в конечном итоге удаляются из пула буферов [1], и с тех пор они никогда не возвращаются к экземплярам db, если вы не сделаете запрос, который коснется этих страниц.
Вы продолжите оплачивать расходы на хранение (и другие косвенные расходы, такие как снимки), оставляя их неиспользованными. Лучшим вариантом было бы переместить неиспользуемые данные в новый кластер, создать из него моментальный снимок и удалить кластер. Вы всегда можете восстановить данные, когда вам это нужно, восстановив снимок. Исходная база данных может быть очищена путем удаления этих неиспользуемых таблиц. Таким образом, вы платите только за снимок, который дешевле.
Вы также можете экспортировать данные из mysql (скажем, в CSV) и сохранить их в S3 / Glacier. Единственным недостатком является то, что когда вам нужен доступ к данным, может потребоваться гораздо больше времени, чтобы загрузить их обратно в существующий или новый кластер базы данных.
[1] Буферный пул использует LRU для выселения. Когда ваша рабочая нагрузка выполняется долго, в конечном итоге вы исключаете все страницы, связанные с неиспользуемой таблицей. Ссылка: https://dev.mysql.com/doc/refman/5.5/en/innodb-buffer-pool.html