У меня установлен TortoiseSVN, и если я выбрал отображение неверсионных файлов, я могу выбрать Diff из контекстного меню. Откроется WinMerge, где я могу выбрать «Инструменты» -> «Создать патч» для создания Diff-файла.
Обновление: Только что протестировано без WinMerge. Если вы выбрали два файла, откройте Diff TortoiseMerge, где вы можете выбрать «Редактировать» -> «Создать унифицированный файл сравнения».