С моей точки зрения, вы должны спросить себя: почему вы хотите иметь такую общую заглушку микросервиса, которую все остальные службы должны использовать в качестве основы. Я знаю, что есть веские причины, но одной из сильных сторон микросервисной архитектуры является то, что каждый сервис может использовать технологию, которая лучше всего подходит для его бизнес-потребностей.
Возвращаясь к вашему вопросу, вы можете создать Git-репозиторий с базовой настройкой JHipster, который содержит только те части приложения, которые должны быть общими для всех микросервисов. Затем вы можете создать форки этого репозитория для каждого микросервиса.
Другой подход: вместо одного базового проекта вы можете создать небольшие модули с теми функциями, которые должны быть общими для всех микросервисов, например общий механизм регистрации. Тогда все микросервисные проекты могут использовать эти модули в качестве зависимостей.