Я писал об этом раньше .
services.AddSwaggerGen(options =>
{
options.AddSecurityDefinition("oauth2", new ApiKeyScheme
{
Description = "Standard Authorization header using the Bearer scheme. Example: \"bearer {token}\"",
In = "header",
Name = "Authorization",
Type = "apiKey"
});
options.OperationFilter<SecurityRequirementsOperationFilter>();
Вам потребуется копия SecurityRequirementsOperationFilter, которую вы можете найти путем поиска в Google, или установить из моего Swashbuckle.AspNetCore.Filters пакета.