Другое решение: поставьте одно из этих правил перед вашими правилами:
RewriteRule ^(css|js|admin|config|…)(/|$) - [L]
RewriteCond %{DOCUMENT_ROOT}$0 -d
RewriteRule ^[^/]+ - [L]
Последнее именованное правило будет работать для любого существующего каталога, но только в том случае, если оно помещено в файл .htaccess в корневом каталоге документов сервера. В противном случае вам нужно будет настроить RewriteCond
выражение %{DOCUMENT_ROOT}$0
с конкретным путем, например, %{DOCUMENT_ROOT}foo/bar/$0
.