Растянуть массив и заполнить нан - PullRequest
0 голосов
/ 22 января 2019

У меня есть 1-й массив numpy длиной n, и я хочу растянуть его до m (n

Ответы [ 4 ]

0 голосов
/ 24 января 2019

Хотя Крис решил проблему, я нашел более короткий ответ, который может оказаться полезным,

def stretch2(x,to,fill=np.nan):
    output  = np.repeat(fill,to)
    foreign = np.linspace(0,to-1,len(x)).round().astype(int)
    output[foreign] = x
    return output

, очень похожий на мою первую попытку.Время:

>>> x = np.random.rand(1000)
>>> to = 1200
>>> %timeit stretch(x,to) # Chris' version
>>> %timeit stretch2(x,to)

996 µs ± 22.9 µs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1000 loops each)
32.2 µs ± 339 ns per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 10000 loops each)

Проверьте, работает ли оно правильно:

>>> aa = stretch2(x,to)
>>> np.diff(np.where(np.isnan(aa))[0])
array([6, 6, 6, ... , 6])
>>> np.sum(aa[~np.isnan(aa)] - x)
0.0

Проверьте граничные условия:

>>> aa[:5]
array([0.78581616, 0.1630689 , 0.52039993,        nan, 0.89844404])
>>> aa[-5:]
array([0.7063653 ,        nan, 0.2022172 , 0.94604503, 0.91201897])

все выполнено.Работает для всех 1-й массивов и может быть обобщен для работы с nd-массивами, с некоторыми изменениями.

0 голосов
/ 22 января 2019

Этот подход размещает элементы non-nan на границах, оставляя значения nan в центре, хотя он не будет равномерно распределять значения nan.

arr = [4,5,1,2,6,8]   
stretch_len = 8    

def stretch(arr, stretch_len):
    stretched_arr = np.empty(stretch_len)   
    stretched_arr.fill(np.nan)
    arr_len = len(arr)

    if arr_len % 2 == 0:
        mid = int(arr_len/2)
        stretched_arr[:mid] = arr[:mid]
        stretched_arr[-mid:] = arr[-mid:]
    else:
        mid = int(np.floor(arr_len/2))
        stretched_arr[:mid] = arr[:mid]
        stretched_arr[-mid-1:] = arr[-mid-1:]

    return stretched_arr

Вот несколько тестов, которые я тестировал:

Контрольные примеры:

In [104]: stretch(arr, stretch_len)   
Out[104]: array([ 4.,  5.,  1., nan, nan,  2.,  6.,  8.])

In [105]: arr = [4, 5, 1, 2, 6, 8, 9]    

In [106]: stretch(arr, stretch_len)  
Out[106]: array([ 4.,  5.,  1., nan,  2.,  6.,  8.,  9.])

In [107]: stretch(arr, 9)  
Out[107]: array([ 4.,  5.,  1., nan, nan,  2.,  6.,  8.,  9.])
0 голосов
/ 22 января 2019

Использование roundrobin из itertools Рецепты :

from itertools import cycle, islice

def roundrobin(*iterables):
    "roundrobin('ABC', 'D', 'EF') --> A D E B F C"
    # Recipe credited to George Sakkis
    pending = len(iterables)
    nexts = cycle(iter(it).__next__ for it in iterables)
    while pending:
        try:
            for next in nexts:
                yield next()
        except StopIteration:
            pending -= 1
            nexts = cycle(islice(nexts, pending))

def stretch(x, to, fill=np.nan):
    n_gaps = to - len(x)
    return np.hstack([*roundrobin(np.array_split(x, n_gaps+1), np.repeat(fill, n_gaps))])

arr = [4,5,1,2,6,8]
stretch(arr, 8)
# array([ 4.,  5., nan,  1.,  2., nan,  6.,  8.])

arr2 = np.random.rand(655)
stretched_arr2 = stretch(arr,662)
np.diff(np.argwhere(np.isnan(stretched_arr2)), axis=0)
# nans are evenly spaced    
array([[83],
       [83],
       [83],
       [83],
       [83],
       [83]])

Логика позади

n_gaps: вычисление количества пробелов для заполнения (желаемая длина -текущая длина)

np_array_split: при n_gaps+1 он разбивает входной массив на максимально возможную длину

roundrobin: поскольку np_array_split генерирует на один массив больше, чем пробелы, roundrobin-ing (т. е. альтернативно итерация) гарантирует, что np.nan никогда не будет на обоих концах результата.

0 голосов
/ 22 января 2019

Вы можете использовать resize для изменения размера массива.

После изменения размера вы можете применить соответствующую логику для переупорядочения содержимого.

Проверьте ссылку ниже: https://docs.scipy.org/doc/numpy/reference/generated/numpy.ndarray.resize.html

...