Вам понадобится долго работающее приложение на c #, либо консольное приложение, которое не исчезнет, либо служба Windows, работающая с использованием служб Windows.
В этом приложении вы подключаетесь к своей БД, выполняете запрос и действуете так, как хотите.
Другой вариант - написать обычное приложение на c #, которое запрашивает БД и воздействует на результат. Затем просто запланируйте его в своем планировщике Windows (вручную), чтобы он выполнялся с любым интервалом, который вы хотите.