Существует множество способов экспорта данных из SQL Server, пожалуйста, посмотрите большинство (если не все) вариантов здесь - http://www.sqlservercentral.com/articles/Export/147145/
Я бы лично пошел с автоматизацией истинного PowerShell, ниже вы можете увидетькак экспортировать его для одной таблицы:
Запустить в PowerShell:
Import-Module SQLPS
$SQLCommand = “SELECT * FROM [AdventureWorks].[Production].[Products]”
Invoke-Sqlcmd -query $SQLCommand | Export-Csv -Path C:\Export.csv -NoTypeInformation
Конечно, вы можете автоматизировать его, подготовить список необходимых вам таблиц и перейти ккаждый цикл верен всем им.