Я думаю, что это какая-то ошибка в TexSoup.
А именно, если вместо этого вы удалите первую строку или закомментируете вторую строку, TexSoup сможет проанализировать файл, и print(soup)
даст некоторый вывод.
Кроме того, если вы заканчиваете первую строку, добавляя фигурные скобки:
%{\documentstyle[aps,epsf,rotate,epsfig,preprint]{revtex}}
TexSoup также может анализировать файл.