Насколько я понял, эти элементы будут добавлены в вашу форму с помощью некоторых манипуляций с DOM.
В этом случае просто создайте некоторый класс, который будет представлять сущность формы и будет иметь все возможные поля, которые вам нужны и которые ожидаются в вашем контроллере:
public void controllerMethod(FormDataObject formData){
//logic
}
В вашей логике контроллера просто проверьте, существуют ли данные в полезной нагрузке запроса.