Разархивируйте файл .war, сгенерированный maven, и сравните его с тем, который генерирует Eclipse.Обычно вы должны указать maven исключить пакеты из определенных артефактов, в противном случае они будут упакованы дважды (это почти то, что говорит ошибка - что развертыватель уже столкнулся с компонентом с определенным именем, и это не имеет смысла делать это дважды).)
Примечание. Приведенное выше решение является возможным решением, если вы строите проект с помощью Maven.