Итак, здесь есть несколько вещей:
Ни один крупный проект с открытым исходным кодом в наше время не работает без системы сборки.Это может быть maven, gradle, sbt, ..
Вы игнорировали все наши документы о сборке из исходного кода и тому подобное.Вам не нужно это делать.Используйте систему сборки, как и предполагалось.
Мое предложение здесь:
Узнайте, что сделал остальной мир Java, и используйте maven: Наш быстрый старт здесь: http://deeplearning4j.org/quickstart
Следуйте нашим примерам для последних версий: https://github.com/deeplearning4j/dl4j-examples
Скорее всего, вам не нужно строить из исходного кода (это касается 5 других проектов, которые вы, вероятно, не хотите делать)- но если вы абсолютно должны быть готовы использовать c ++ среди прочего.
Руководство по этому можно найти здесь: https://deeplearning4j.org/devguide