Я думаю, нам нужно увидеть больше последовательности команд.Не очевидно, что точки, видимые на вашей фигуре, происходят из команды «splot»."set grid dashtype '.'" может создать такую вещь.У вас есть команда "установить сетку"?Я предполагаю, что последовательность команд, которая вам нужна, выглядит примерно так:
unset grid
set pm3d explicit
set contours
splot 'DM_Plot.txt' using 1:($2/1000):3 with pm3d, \
'DM_Plot.txt' using 1:($2/1000):3 with labels
Это соответствует тому, что вы пробовали?